O IGCS foi concebido por um empreendedor moçambicano oriundo da cidade de Nampula, Excia. Paulo Jorge Henriques, cuja visão foi forjada pelas experiências vivenciadas durante sua educação. Identificando uma lacuna na formação técnico-profissional da sociedade moçambicana, especialmente entre os jovens de sua região, ele reconheceu a necessidade premente de uma educação de qualidade que capacitasse os indivíduos com habilidades práticas. Graduado pelo Instituto Industrial e Comercial de Maputo em Contabilidade e posteriormente Licenciado em Contabilidade e Gestão, ele enveredou pelo caminho do empreendedorismo.

Assim, surgiu a concepção do Instituto Técnico de Negócios (ITN), oficialmente estabelecido no ano de 2013 mediante a aprovação da então Direção Provincial de Educação e Cultura, hoje Direção Provincial de Educação e Desenvolvimento Humano, sob a tutela ministerial.
O ITN inaugurou suas atividades educacionais em fevereiro de 2014, oferecendo inicialmente dois cursos: Técnico de Contas e Técnicos Aduaneiros, ambos com duração de três anos. No entanto, em resposta à demanda e às dinâmicas do mercado, o ITN reconheceu a necessidade de expandir sua oferta educacional para incluir cursos na área da saúde.

Assim, em 2016, o ITN introduziu o curso de Técnicos Médios de Administração Hospitalar, seguido no ano subsequente pelos cursos de Medicina curativa, como é o caso do curso de Técnicos de Medicina Geral e Enfermagem de Saúde Materno Infantil. Com a evolução do perfil dos cursos oferecidos, o nome "Instituto Técnico de Negócios" tornou-se inadequado, o que levou à mudança para o atual Instituto de Gestão e Ciências de Saúde, conhecido como IGCS.

Em 2018, o IGCS celebrou sua primeira cerimônia oficial de graduação, conferindo diplomas a um total de 254 graduandos. Atualmente, o IGCS está sediado e opera exclusivamente na cidade de Nampula, oferecendo quatro cursos: Técnicos de Medicina Geral, Enfermagem Geral, Enfermagem de Saúde Materno Infantil e Técnicos de Laboratório.